宋楠并不关心朝廷上下怎么想，在和国公府的婚约订立之后，宋楠的全部重心转到对锦衣卫衙门的整饬上来，锦衣卫衙门虽然执掌在自己手中，但说到底，这个衙门还不能如臂指使，长久以来的积弊看在眼中，以前自然可以眼不见为净，如今可不能听之任之。
宋楠大刀阔斧的对锦衣卫衙门进行了一番大清洗，辖下京内外千户所共计二十一个，所辖缇骑两万多人，鱼龙混杂，混乱不堪；粗略一查，当中竟有两千多员是世袭混事的编制，也即是说，这些人都是混饷银不干事的主儿；另外宋楠也清楚，锦衣卫中混杂了不少其他部门的耳目，譬如东厂的耳目，不但总衙有，京中有，各地的千户所中也肯定不少，宋楠岂会容忍有这些人存在。
九月中旬，宋楠下达了清空空额编制的命令，数千拿钱挂职却不干事的锦衣卫官员被一并裁退，一时间哀鸿遍野，震动京师；很多人托着各种关系和名目来打招呼求肯，被宋楠一概拒之门外；事情很快便被捅到了正德那里，但正德有言在先，不干涉宋楠对锦衣卫衙门的整饬，就连刘瑾也不出一言。
清退这两千余空额之后，光从经费开支上便每年可省出近十万两银子的费用来，用来填补正常衙门克扣的饷银虽然稍显不足，但起码聊胜于无。
更重要的是，这些空额大多是百户旗官等小官职，如此一来等于让一大批锦衣卫缇骑有了晋升的空间，所起的积极效果远甚于节省下来的费用。
紧接着便是对于锦衣卫内部的肃清，宋楠派出二十一只内部督查组进驻京城和各地衙门中，采取公开和不公开两种方式进行稽核肃清。
针对的无非是两种人，一种是办事效率低下，人浮于事混迹其中的锦衣卫人员，另一种则是混迹在锦衣卫内部的耳目；所谓公开的方式便是张贴总衙限期自查公告，言明在九月三十日之前，所有之前有过过错的锦衣卫官员必须主动找稽核督查组坦白交代，但主动交代者，重案从轻，轻案从无，既往不咎；但凡过了期限者，一旦查实，一律从重从快处置。
非公开的方式便是让各衙门中人暗中举报，举报查实，从重处理，举报之人奖励升职。
这又是一枚重磅炸弹在锦衣卫衙门中炸响，一时间锦衣卫上下人心惶然，个个自危；锦衣卫中的官员和缇骑何曾经受过这样的大地震，很快便有人领头开始抗辩，找到内外廷各衙门投递各种针对宋楠的诋毁之言，称宋楠搞乱锦衣卫衙门，胡乱罗织罪名，弄得天怒人怨云云。
这些事很快又经由各人之口捅到正德耳边，正德也有些坐不住了，对宋楠的行为他很是不解，这般闹腾起来，对宋楠稳定立足于锦衣卫衙门似乎并无好处。
宋楠在正德询问此事之后只是给予一句话的回答：“不破不立，皇上若信臣，便让臣继续下去，所有的指责，我都将以证据来说明，若臣有
